Στο πλαίσιο του εξαετούς κύκλου (2018-2023) της Οδηγίας-Πλαίσιο για τη Θαλάσσια Στρατηγική (MSFD) οι εκτιμήσεις και οι αξιολογήσεις των αποθεμάτων έγιναν με βάση τη συλλογή στοιχείων από το Εθνικό Πρόγραμμα Συλλογής Αλιευτικών Δεδομένων. Για την αξιολόγηση της κατάστασης του αποθέματος σε σχέση με οποιοδήποτε από τα κύρια κριτήρια απαραίτητη προϋπόθεση είναι η ύπαρξη σημείων αναφοράς, διαφορετικά δεν είναι εφικτή η αποτίμηση. Η αξιολόγηση εστιάζει στις δύο θαλάσσιες περιοχές αναφοράς της ελληνικής επικράτειας σύμφωνα και με FAO GFCM (MRU Ιόνιο – GSA20 και MRU Αιγαίο–Λεβαντίνη GSA22/23) και βασίζεται σε μεθοδολογίες που αναπτύχθηκαν από διεθνείς επιστημονικές ομάδες εργασίας (π.χ. GFCM, STECF, ICCAT) και εφαρμογή κατάλληλων αναλυτικών βιολογικών μοντέλων (π.χ. SPiCT, a4a). Η αξιολόγηση της Καλής Περιβαλλοντικής Κατάστασης (ΚΠΚ/GES) πραγματοποιήθηκε κυρίως για το κριτήριο D3C1 (Αλιευτική Θνησιμότητα). Εφαρμόστηκε ευρέως. Δεν χρησιμοποιήθηκε ο πολυετής δείκτης αλιευμάτων/βιομάζα καθώς η υφιστάμενη χρονοσειρά είναι μικρή και με πολυετή κενά δεδομένων που δεν επέτρεψαν την αξιολόγηση της τάσης του (μείωση, σταθερή ή αύξηση).

Το κριτήριο D3C2 (Αναπαραγωγική Βιομάζα) εφαρμόστηκε μόνο σε αποθέματα με διαθέσιμα δεδομένα και δυναμικά μοντέλα (παρέχουν εκτιμήσεις της συνολικής βιομάζας, και όχι της αναπαραγωγικής βιομάζας του αποθέματος) και αξιολογήθηκε μέσω της αναλογίας B/BMSY. Επιπλέον, οι Μεσογειακές αξιολογήσεις αποθεμάτων υποφέρουν από την έλλειψη ορίων αναφοράς για την αναπαραγωγική βιομάζα λόγω του μικρού μεγέθους των υφιστάμενων χρονοσειρών και ο δείκτης δεν μπορεί να εκτιμηθεί και το επίπεδο της βιομάζας σε σχέση με ΚΠΚ/GES να αποτιμηθεί. Χρησιμοποιήθηκε έτσι ο συνδυασμός F/Fmsy και B/Bmsy για την αποτίμηση της κατάστασης τους σε σχέση με ΚΠΚ με κοινή αποτίμηση των κριτηρίων D3C1 και D3C2, όπως προτείνεται από το Άρθρο 8 της MSFD. Εκτιμήθηκαν επίσης τα αντίστοιχα διαγράμματα Kobe για τα αποθέματα εκείνα που έγιναν εκτιμήσεις με δυναμικά μοντέλα βιομάζας τουλάχιστον δύο χρονιές. H ζώνη βιώσιμης εκμετάλλευσης που πληροί το κριτήριο της ΚΠΚ επιτυγχάνεται όπου F < FMSY και B > BMSY. Ακόμα και αν ένα από τα δύο κριτήρια δεν πληροίται (π.χ., F > FMSY, ή B ≤ BMSY), το απόθεμα θεωρείται «μη ΚΠΚ».