Na subdivisão do Continente, as amostragens serão efetuadas com recolha de água com uma mangueira de integração vertical (torneira/válvula) para a recolha integrada sub-superficial até aos 15m e com garrafas Niskin a partir dos 15m, em estratos de profundidade padrão. O mesozooplâncton será amostrado usando arrastos com redes de plâncton (WP2, Bongo). Serão medidos parâmetros da água do mar com uma sonda multiparamétrica (e.g., CTD com sensores acoplados de fluorescência, oxigénio dissolvido e pH). Os parâmetros medidos in situ serão complementados com soluções de modelos numéricos do oceano (e.g., correntes, salinidade, profundidade da camada de mistura); e dados de satélite (e.g. temperatura da superfície do mar, concentração de clorofila-a). Algumas métricas para os parâmetros a adoptar: Composição parcial da comunidades de microfitoplâncton e mesozooplâncton; Mesozooplâncton gelatinoso vs. larvas/ovos de peixes; Copépodes pequenos vs. copépodes grandes; Crustáceos vs. mesozooplâncton gelatinoso; Biomassa fitoplancton vs. biomassa mesozooplancton; Microfitoplâncton <50um vs. microfitoplâncton >50um, Diatomáceas vs. Microzooplâncton heterotrófico <100um; Rácio entre diferentes grupos funcionais de fitoplâncton. As metodologias laboratoriais para o processamento de amostras incluem: Identificação taxonómica, contagens numéricas e medidas de tamanho de organismos planctónicos por microscopia e análise semiautomática de imagens; implementação de técnicas moleculares/genéticas para a definição de “unidades taxonómicas operacionais”; medições de clorofila por fluorescência após fracionamento manual de amostras por diferentes malhas; Medições de rodamina e ficoeritrina por fluorescência após fracionamento manual de amostras por diferentes malhas; Biomassa de carbono, a partir medições de plâncton por volume deslocado, após fracionamento manual de amostras por diferentes malhas. Biomassa de carbono, a partir medições de plâncton por volume deslocado, após fracionamento manual de amostras por diferentes malhas.

As amostragens serão feitas com recolha de água de superfície (com balde) e com mangueira de integração vertical (torneira/válvula) para a recolha integrada sub-superficial (até 8m). Serão medidos parâmetros da água do mar com uma sonda multiparamétrica (e.g., CTD com sensores acoplados de fluorescência, oxigénio dissolvido e pH). Os parâmetros medidos in situ serão complementados com soluções de modelos numéricos do oceano e dados de satélite. As metodologias laboratoriais para o processamento de amostras incluem: Identificação taxonómica, contagens numéricas e medidas de tamanho de organismos planctónicos por microscopia e análise semiautomática de imagens (obtidas com FlowCam ou equivalente); implementação de técnicas moleculares/genéticas para a definição de “unidades taxonómicas operacionais”; medições de clorofila por fluorescência após fracionamento manual de amostras por diferentes malhas; Medições de rodamina e ficoeritrina por fluorescência após fracionamento manual de amostras por diferentes malhas. Biomassa de carbono, a partir medições de plâncton por volume deslocado, após fracionamento manual de amostras por diferentes malhas. As métricas específicas para os parâmetros são: Abundância / biomassa de plâncton dos vários taxa (expressa em volume, integrada verticalmente e/ou estratificada por profundidades) (ABU / BIOM); Concentração de clorofila a, total e/ou fracionada por tamanho (integrada verticalmente) (CONC-W); Estimativa de clorofila a partir de imagens de satélite (CONC-W); Diversidade de grupos planctónicos (SPP-C); Duração dos eventos de florescência (bloom) do fitoplâncton (DUR); Frequência de eventos de florescência (bloom) de fitoplâncton (FRE); Frequência de grupos taxonómicos / funcionais / tróficos (FRE); Classificação por tamanhos (LEN); Biomassa de carbono (ou peso seco) no total e/ou fracionado por tamanho (BIOM); pH (PH); Salinidade (SAL); Temperatura (TEM); Concentração de oxigénio dissolvido (CONC-W); Percentagem de saturação de oxigénio (CONC-W); Outros (OTH): fluorescência; composição de pigmentos; diferenças de volume.

As amostragens para o fitoplâncton e microzooplâncton serão efetuadas com recolha de água com uma mangueira de integração vertical (torneira/válvula) para a recolha integrada sub-superficial até aos 15m e com garrafas Niskin a partir dos 15m, em estratos de profundidade padrão. O mesozooplâncton será amostrado através de arrastos com redes de plâncton (WP2, Bongo) em toda a coluna de água ou em estratos de profundidade padrão. Serão medidos parâmetros da água do mar com uma sonda multiparamétrica (e.g., CTD com sensores acoplados de fluorescência, oxigénio dissolvido e pH). Os parâmetros medidos in situ serão complementados com soluções de modelos numéricos do oceano e dados de satélite. As metodologias laboratoriais para o processamento de amostras incluem: Identificação taxonómica, contagens numéricas e medidas de tamanho de organismos planctónicos por microscopia e análise semiautomática de imagens (obtidas com FlowCam ou equivalente); implementação de técnicas moleculares/genéticas para a definição de “unidades taxonómicas operacionais”; medições de clorofila por fluorescência após fracionamento manual de amostras por diferentes malhas; Medições de rodamina e ficoeritrina por fluorescência após fracionamento manual de amostras por diferentes malhas. Biomassa de carbono, a partir medições de plâncton por volume deslocado, após fracionamento manual de amostras por diferentes malhas. As métricas específicas para os parâmetros são: Abundância / biomassa de plâncton dos vários taxa (expressa em volume, integrada verticalmente e/ou estratificada por profundidades) (ABU / BIOM); Concentração de clorofila a, total e/ou fracionada por tamanho (integrada verticalmente) (CONC-W); Estimativa de clorofila a partir de imagens de satélite (CONC-W); Diversidade de grupos planctónicos (SPP-C); Duração dos eventos de florescência (bloom) do fitoplâncton (DUR); Frequência de eventos de florescência (bloom) de fitoplâncton (FRE); Frequência de grupos taxonómicos / funcionais / tróficos (FRE); Classificação por tamanhos (LEN); Biomassa de carbono (ou peso seco) no total e/ou fracionado por tamanho (BIOM); pH (PH); Salinidade (SAL); Temperatura (TEM); Concentração de oxigénio dissolvido (CONC-W); Percentagem de saturação de oxigénio (CONC-W); Outros (OTH): fluorescência; composição de pigmentos; diferenças de volume.